El diseño de los objetivos y lineamientos generales del Proyecto es llevado adelante por una Comisión de Trabajo y Consenso creada por decreto en el año 2003. La misma está conformada por Organismos de Derechos Humanos, sobrevivientes del CCDyT, familiares de desaparecidos vistos en el "Club Atlético", organizaciones barriales y sociales y áreas del Gobierno de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires.
Integrantes de la Comisión de Trabajo y Consenso
Organismos de Derechos Humanos
● Abuelas de Plaza de Mayo
● Madres de Plaza de Mayo - Línea Fundadora
● H.I.J.O.S. (Hijos por la Identidad y la Justicia contra el Olvido y el Silencio)
● Familiares de Desaparecidos y Detenidos por Razones Políticas
● Asociación de ex-Detenidos Desaparecidos
● SERPAJ (Servicio Paz y Justicia)
● A.P.D.H. (Asamblea Permanente por los Derechos Humanos)
● CELS (Centro de Estudios Legales y Sociales)
● Fundación Memoria Histórica y Social Argentina
● M.E.D.H. (Movimiento Ecuménico por los Derechos Humanos)
Sobrevivientes del CCDyT "Club Atlético"
Familiares de Detenidos Desaparecidos vistos en el CCDyT "Club Atlético"
Instituto Espacio para la Memoria
Organismos barriales y sociales
● Asamblea de San Telmo - Plaza Dorrego
● Encuentro por la Memoria de Barracas, La Boca y San Telmo
● CTA (Central de Trabajadores Argentinos)
Áreas del Gobierno de la Ciudad Autónoma de Buenos Aires